Daniel Fernández Marchán, Rosa Fernández, Jorge Domínguez, Darío J. Díaz Cosín &Marta Novo

Genome-informed integrative taxonomic description of three cryptic species in the earthworm genus Carpetania (Oligochaeta, Hormogastridae)

Systematics and Biodiversity · April 2020

DOI: 10.1080/14772000.2020.1730474

RESUMEN

La investigación sobre complejos de especies crípticas ha alcanzado un consenso sobre la necesidad de integrar múltiples fuentes de evidencia. Las técnicas de librerías de representación reducida como Genotyping-by-Sequencing (GBS) se han mostrado útiles para el estudio de estos grupos. Ni la taxonomía integrativa ni los datos de polimorfismos de nucleótido único (SNP) a escala genómica han sido aplicados ampliamente a las lombrices de tierra, un grupo animal con una presencia muy extendida de diversidad críptica. Se ha mostrado que el género Carpetania (previamente el complejo de especies Hormogaster elisae) contiene seis linajes genéticos profundamente divergentes en base a unos pocos marcadores moleculares tradicionales, con cierta diferenciación morfológica en caracteres inconspicuos. Marchán et al. (2020) delimitaron tres clados de nivel específico bien soportados, a partir de un set de datos SNP a escala genómica y de análisis morfométricos geométricos, destacando la necesidad de una descripción taxonómica formal de dichos taxones. En este trabajo se aplicaron análisis adicionales a los datos SNP, así como un estudio morfológico en profundidad con el fin de proporcionar una descripción integrativa de dos nuevas especies y redescribir Carpetania elisae. Se identificaron SNPs específicos para cada especie usándose como caracteres diagnósticos, y se compararon las distancias genómicas y las distancias en el gen citocromo oxidasa C subunidad 1 (COI) encontrando una fuerte correlación entre ellas. La descripción taxonómica de estas tres especies crípticas proporciona una herramienta útil para incluirlas de manera efectiva en estudios ecológicos y en acciones de conservación de la biodiversidad.