Rubio-Teves M, Díez-Hermano S, Porrero C, Sánchez-Jiménez A, Prensa L, Clascá F, García-Amado M, Villacorta-Atienza JA.

Benchmarking of tools for axon length measurement in individually-labeled projection neurons

PLoS Comput Biol. 2021 Dec 8;17(12):e1009051

DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009051

RESUMEN

Las neuronas de proyección son el tipo neuronal más común en el cerebro de los mamíferos y su caracterización individual es un paso crucial para comprender los circuitos neuronales. Estas células tienen un axón que se ramifica en patrones complejos a múltiples regiones del cerebro, y su longitud es una estimación crítica del impacto funcional de la neurona. No obstante, su medición directa es un método lento y laborioso. Por el contrario, las estimaciones de la longitud axonal se han propuesto recientemente como una alternativa eficaz y accesible, que permite una aproximación rápida a la importancia funcional de la neurona individual. En este trabajo analizamos la precisión y la eficiencia de las herramientas de estimación de longitud axonal más utilizadas, simulando computacionalmente cada una de ellas y aplicándolas sobre un conjunto de 951 axones reconstruidos en 3D. El rendimiento de cada método de estimación de la longitud axonal se complementó con el esfuerzo humano, la experiencia, el know-how y la asequibilidad económica requeridos por cada herramienta. Pretendemos así proporcionar una guía constructiva que permita ayudar en la selección del método más eficiente para caracterizar morfologías axonales de acuerdo con las circunstancias particulares de la investigación realizada.